Vicena 标志 Vicena
Vicena Compute，由 Rowan 支持高级建模

在维思纳中运行高级计算化学。

准备建模工作流、运行范围受控的模拟、检查输出，并在同一个工作区中迭代到下一步科学决策。

技术支持 Rowan

开始工作

运行计算

检查结果

rowan_binding_visuals.ipynb
Vicena workspace showing a Rowan-powered docking notebook and molecular visualization

真实计算工作

不止于 AI 摘要。直接从研究工作区运行分子分析、建模和模拟工作流。

高性能化学计算

当轻量分析不够时，使用可扩展计算完成更高级的化学任务。

从上下文出发

从论文、分子、实验方案、测定条件或实验结果开始，而不是从空白工具界面开始。

在维思纳中迭代

复查输出、细化假设、比较候选，并决定下一步测试什么。

Unified Vicena science workspace with molecules, proteins, notebooks, and simulation outputs

不只是 AI 回答，而是执行科学工作。

专注化学问题，而不是基础设施。

大多数 AI 工具可以解释化学。维思纳是为了帮助科学家真正完成化学工作而构建的。

描述科学目标，准备计算工作流，运行范围受控的任务，并在笔记本、图表、结构和摘要中检查结果。

价值不在于另一个聊天界面，而在于帮助研究人员从问题走到计算，再走到决策。

可检查的计算输出

从模拟文件到科学决策。

维思纳让计算输出保持可见且可用：分子结构、笔记本、表格、图表、评分、日志和摘要。

科学家可以检查结果、质疑结果、比较替代方案，并用它决定下一步。

Vicena-generated docking visualization of Nirmatrelvir bound to SARS-CoV-2 main protease

维思纳生成的对接结果

围绕科学目标工作，而不是围绕工具工作。

这张图是一个例子：对接计算把配体放入蛋白结合口袋中，供研究人员检查。

使用维思纳时，科学家从问题、分子、蛋白、论文、测定结果或实验开始，维思纳会围绕它准备合适的计算工作流。

结合口袋几何

配体姿态检查

可直接进入笔记本的输出

分子系统

分子系统

检查分子、配体、蛋白和结构上下文。

候选结构

候选结构

比较构象、姿态和生成的分子几何结构。

计算证据

计算证据

把计算转化为表格、图表和笔记本输出。

决策支持

决策支持

用结果比较候选、优化实验，并选择下一步测试对象。

科学计算软件包

支撑计算化学与分子动力学的科学计算软件包。

  1. Rowan

    托管分子工作流层

    提供托管 API、数据模型、计算路由和可复现工作流层，将 Vicena 连接到分子计算。

  2. AIMNet2 / fairchem

    神经网络原子间势

    提供快速的机器学习能量与力计算，包括面向有机分子的 AIMNet2，以及通过 fairchem 提供的 OMol25 系列模型。

  3. xTB / CREST

    半经验化学与构象搜索

    运行 GFN 系列半经验计算，并支持高效的几何、能量、描述符和构象搜索工作流。

  4. PySCF / GPU4PySCF

    分子电子结构

    运行 Hartree–Fock 与密度泛函理论，并为常规和高精度量子化学任务提供 GPU 加速预设。

  5. Psi4

    波函数量子化学

    为 Hartree–Fock、密度泛函和相关电子结构方法提供模块化量子化学引擎。

  6. Quantum ESPRESSO

    周期性平面波 DFT

    处理周期材料、平面波电子结构、晶体几何及相关固体计算。

  7. OpenFold3

    开放生物分子共折叠

    根据蛋白质、核酸、离子和小分子输入预测三维生物分子复合物。

  8. Boltz

    结构与亲和力模型

    支持 Boltz-1、Boltz-2 和 Boltz-2.1 共折叠工作流，并输出结构化置信度、构象和亲和力结果。

  9. Chai-1r

    生物分子结构预测

    通过 Rowan 工作流为蛋白质、核酸和配体复合体系提供互补的共折叠模型。

  10. ColabFold / MMseqs2

    多序列比对

    为结构预测工作流生成私有、可复现的蛋白质比对，并输出 Boltz、Chai 和 ColabFold 格式。

  11. OpenMM / OpenFF

    GPU 分子动力学

    使用 OpenFF 配体参数构建显式溶剂蛋白质–配体体系，并在 OpenMM 中运行 GPU 加速动力学。

  12. Vina / QVina2 / Gnina

    蛋白质–配体对接

    使用 Vina 系列或 Gnina 设置搜索结合构象，并支持精修、去重和构象质量检查。

  13. TMD

    相对结合自由能

    在配体转换图上运行 GPU 优化的自由能微扰，用于预测相对结合亲和力。

  14. geomeTRIC / Sella / ASE

    几何优化

    协调分子和周期性几何优化、约束、过渡态计算与晶胞弛豫。

  15. RDKit

    分子信息学与准备

    处理结构、立体化学、构象、描述符、指纹、氢原子、键级和化学感知分析。

应用说明

把计算化学看成完整的科学故事。

维思纳应用说明展示如何从熟悉的科学问题走到笔记本输出、图表、结构、限制和下一步决策。

咖啡因如何作用于 A2A 受体

应用说明

咖啡因如何作用于 A2A 受体

一份从咖啡到受体的计算说明，使用 PK 建模、Rowan 对接输出、受体结构和可检查的笔记本工件。

示例请求

从真实科学任务开始。

科学家可以在 Vicena Compute 中开始这些工作：

可扩展计算访问

包含额度。工作扩大时可充值。

维思纳套餐使用共享账号额度，覆盖符合条件的计算化学、AI、笔记本和工具工作流。

免费版不包含 Rowan 或外部模拟工作流。Plus 和 Ultra 在订阅内包含探索性工作；更大或重复的模拟可使用手动充值和按量付费。

单任务限制帮助团队扩展计算，同时控制支出。

比较套餐

符合条件的工作流共享月度额度。

手动充值会扩展同一个账号预算，用于 AI、笔记本、Rowan 和未来服务。

通过单任务限制降低失控支出。

为共享研究预算提供团队用量控制。

Plus 和 Ultra 上的部分高级分子建模工作流由 Rowan 提供支持。